RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PEMTQ9UBM1 199 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 NF1P21359 2839 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 CSN3P07498 182 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 SORL1Q92673 2214 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 A0A0J9YX75 114 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 RNF114Q9Y508 228 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 AGRNO00468 2067 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 DNLZQ5SXM8 178 aa13.36□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.36□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 SCGB1D1O95968 90 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3-20P01619 116 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 HIVEP2P31629 2446 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 KLLNB2CW77 178 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 HSBP1O75506 76 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 NOTCH2Q04721 2471 aa13.34□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 D6R8Y8 96 aa13.34□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 H3BVH4 76 aa13.34□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.34□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 U3KQK5 164 aa13.34□□□□□ -0.27
ACTB-201ENST00000331789 SNAI2O43623 268 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 SMKR1H3BMG3 65 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 CCL24O00175 119 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 GNRH2O43555 120 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 SPRY2O43597 315 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 OR5AL1P0C617 328 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 RNF185Q96GF1 192 aa13.33□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 LINC00614P0C842 121 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 RAB4AP20338 218 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 FHL3Q13643 280 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 PMCHL1Q16048 86 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 M0R2Z0 102 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 LEPP41159 167 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 PRELID3AQ96N28 172 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 KRTDAPP60985 99 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 ORMDL3Q8N138 153 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 KNCNA6PVL3 124 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 INAFM1C9JVW0 142 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA7O95182 113 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 NCR2O95944 276 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 CKS2P33552 79 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 ASIPP42127 132 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 DEFB131AP59861 70 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 S100A12P80511 92 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 ODF3Q96PU9 254 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 C7orf71A4D174 169 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 GAS8-AS1O95177 125 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 EVI2AP22794 236 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 CACNG7P62955 275 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 JMJD8Q96S16 334 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.28□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.28□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 ZNF124Q15973 351 aa13.28□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.28□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 PRO1933Q9H354 126 aa13.28□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 NPYP01303 97 aa13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 C3orf79P0CE67 100 aa13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 PROK1P58294 105 aa13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 AMTNQ6UX39 209 aa13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.27□□□□□ -0.28
ACTB-201ENST00000331789 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.27□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 Q8N976 141 aa13.27□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.27□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 M0R381 172 aa13.26□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 CDKN1BP46527 198 aa13.26□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 FXYD7P58549 80 aa13.26□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.26□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 LINC00587B1AMM8 73 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 TSPOP30536 169 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 FA2HQ7L5A8 372 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.25□□□□□ -0.29
ACTB-201ENST00000331789 MUC4Q99102 2169 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms