RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RNF183Q96D59 192 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 GP9P14770 177 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 UBE2AP49459 152 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 WISP1O95388 367 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 HCFC1P51610 2035 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TMEM141Q96I45 108 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 K7EM74 188 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.38□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 SIP14410 1827 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 LMO1P25800 156 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RHODO00212 210 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 MPZP25189 248 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CCL18P55774 89 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.37□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 SPRNQ5BIV9 151 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 NDUFA4O00483 81 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZR03 302 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PTPN13Q12923 2485 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 COLCA2A8K830 154 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PRSS46E5RG02 174 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 COX7B2Q8TF08 81 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CARD19Q96LW7 228 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 A0A087WW49 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 SLAQ13239 276 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.36□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CRYBA4P53673 196 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 DAND5Q8N907 189 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TM2D2Q9BX73 214 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 AMTNQ6UX39 209 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 Q8N8P6 123 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 GTSF1Q8WW33 167 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.35□□□□□ -1.07
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CLN8-201ENST00000331222 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PRSS33Q8NF86 280 aa8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ZNF124Q15973 351 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 DEFB135Q30KP9 77 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RNF138Q8WVD3 245 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 Q9H8V8 135 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 DKK2Q9UBU2 259 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CEND1Q8N111 149 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 RITA1Q96K30 269 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 ELANEP08246 267 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 H3BMG7 143 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 CREBBPQ92793 2442 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 PDE6HQ13956 83 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 A8MWP6 167 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 BLCAPP62952 87 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 VOPP1Q96AW1 172 aa8.34□□□□□ -1.07
CLN8-201ENST00000331222 SPG11Q96JI7 2443 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 HERVK_113P63121 156 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 PRR25Q96S07 402 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 RHOHQ15669 191 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 NPYP01303 97 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 UBE2V1Q13404 147 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 LINC01559Q495D7 138 aa8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 H3BRN7 92 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 QRFPP83859 136 aa8.32□□□□□ -1.08
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