RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-201ENST00000325599 IGHV1-69P01742 117 aa12.53□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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SHQ1-201ENST00000325599 PCP2Q8IVA1 136 aa12.44□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 OR11H1Q8NG94 326 aa12.44□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 OR11H2Q8NH07 326 aa12.44□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 BRI3O95415 125 aa12.43□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PF4V1P10720 104 aa12.43□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 H3BVH4 76 aa12.43□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 AVPP01185 164 aa12.43□□□□□ -0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
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