RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 C18orf15Q96N68 181 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ZMAT4Q9H898 229 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA1AO00555 2505 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 LAGE3Q14657 143 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.84□□□□□ -0.03
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SPNS1-201ENST00000311008 ASIPP42127 132 aa14.83□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 DKK2Q9UBU2 259 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A16P16260 332 aa14.82□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZQT7 251 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 ITPR1Q14643 2758 aa14.82□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZS46 218 aa14.8□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 TM4SF20Q53R12 229 aa14.8□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 TMEM89A2RUT3 159 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 K7EMI3 77 aa14.79□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 J3KRW8 73 aa14.78□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 AVPP01185 164 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 C20orf78Q9BR46 151 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 A6NDN8 102 aa14.78□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 NMUP48645 174 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.78□□□□□ -0.04
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SPNS1-201ENST00000311008 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-201ENST00000311008 J3QLI3 93 aa14.77□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 M0R381 172 aa14.77□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 C7orf71A4D174 169 aa14.75□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 CBY3A6NI87 242 aa14.75□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 A6NJY4 79 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.75□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.75□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 PCP2Q8IVA1 136 aa14.74□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 AP1S3Q96PC3 154 aa14.74□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.74□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 F6UB75 175 aa14.74□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 HIGD1BQ9P298 99 aa14.74□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB1P60022 68 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087WX48 190 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 H3BRM9 83 aa14.73□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 DCANP1Q8TF63 244 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 RASL10AQ92737 203 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV4-59P01825 116 aa14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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SPNS1-201ENST00000311008 PLNP26678 52 aa14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 TCTAP57738 103 aa14.71□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 ODF3Q96PU9 254 aa14.71□□□□□ -0.05
SPNS1-201ENST00000311008 GNRH2O43555 120 aa14.7□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.7□□□□□ -0.06
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SPNS1-201ENST00000311008 TOMM6Q96B49 74 aa14.7□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM160Q9NX00 188 aa14.7□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM238C9JI98 176 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 MGPP08493 103 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 SRD5A1P18405 259 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-201ENST00000311008 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.68□□□□□ -0.06
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