RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-201ENST00000256413 TCL1BO95988 128 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.63□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.63□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.63□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 GATA4P43694 442 aa12.62□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.62□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V0E1O15342 81 aa12.62□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 PATE2Q6UY27 113 aa12.62□□□□□ -0.39
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CTIF-201ENST00000256413 H3BUX3 64 aa12.59□□□□□ -0.39
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CTIF-201ENST00000256413 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 TOMM6Q96B49 74 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 TM2D2Q9BX73 214 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZSR3 168 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 PRB1P04280 392 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 B4DSR2 109 aa12.56□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.56□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 C11orf86A6NJI1 115 aa12.56□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 SAA4P35542 130 aa12.56□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.56□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 SPRY2O43597 315 aa12.55□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.55□□□□□ -0.4
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF503Q96F45 646 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 LINC01356Q8N9X3 169 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 ODF3L1Q8IXM7 274 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 ROS1P08922 2347 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 IGLV2-8P01709 118 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 XCL2Q9UBD3 114 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 V9GYY9 64 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 TIMM17AQ99595 171 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 PKIGQ9Y2B9 76 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-201ENST00000256413 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 DEFB130BP0DP73 79 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 DEFB130AP0DP74 79 aa12.51□□□□□ -0.41
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