RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 SLURP1P55000 103 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM258P61165 79 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 MPDZO75970 2070 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZR03 302 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 NRGNQ92686 78 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 COL4A6Q14031 1691 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYGCP07315 174 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf47Q569G3 176 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ESM1Q9NQ30 184 aa6.9□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PRSS46E5RG02 174 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 POLEQ07864 2286 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FNDC10F2Z333 226 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FGF16O43320 207 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C3orf79P0CE67 100 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 MORN5Q5VZ52 161 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FREM3P0C091 2139 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 J3KT08 172 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZRM9 215 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV2-5P01817 119 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.89□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N8P6 123 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 UBL5Q9BZL1 73 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 F6UB75 175 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 BRK1Q8WUW1 75 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK7Q96N67 2140 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BRN7 92 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CCL25O15444 150 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 HERVK_113P63121 156 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf118A6NHY6 69 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHG4P01861 327 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 SPANXCQ9NY87 97 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 U3KQA8 63 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CEP250Q9BV73 2442 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 F8W1H4 67 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 GYPEP15421 78 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 QRFPP83859 136 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.87□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 GNRH2O43555 120 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CFHR4Q92496 578 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EP34 96 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR25Q96S07 402 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EM74 188 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 WDR86Q86TI4 376 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2AP49459 152 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF492Q9P255 531 aa6.86□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZS49 121 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GW64 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 SHISA9B4DS77 424 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf38Q86SI9 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BUA1 57 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP5G1P05496 136 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 CADP27708 2225 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0U1RQV1 116 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB4AO15263 64 aa6.85□□□□□ -1.31
CYFIP1-208ENST00000617928 HLA-DMBP28068 263 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms