RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
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PTPRF-216ENST00000617451 Q8TAT8 98 aa16.93■□□□□ 0.3
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PTPRF-216ENST00000617451 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTPRF-216ENST00000617451 Q5VSD8 79 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRF-216ENST00000617451 C9JCJ5 164 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.81■□□□□ 0.28
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PTPRF-216ENST00000617451 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R45P59539 299 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 OTORQ9NRC9 128 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 LRCOL1A6NCL2 159 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 PGPA6NDG6 321 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 CMTM2Q8TAZ6 248 aa16.73■□□□□ 0.27
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