RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608442.1

AFAP1-AS1-201, AFAP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AFAP1-AS1, Length 6,795 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.34□□□□□ -1.23
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AFAP1-AS1-201ENST00000608442 C5orf38Q86SI9 138 aa7.34□□□□□ -1.23
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AFAP1-AS1-201ENST00000608442 VOPP1Q96AW1 172 aa7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 SPTA1P02549 2419 aa7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 F8W735 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.29□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.28□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 PROP1O75360 226 aa7.28□□□□□ -1.24
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.241e-6■■■□□ 16.7
AFAP1-AS1-201ENST00000608442 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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