RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 CRISP2P16562 243 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB131AP59861 70 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-227ENST00000598960 A8MTW9 85 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 A8MWL6 223 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TYMSP04818 313 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 CD33P20138 364 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TCL1AP56279 114 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 PRR9Q5T870 116 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 NEU1Q99519 415 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.52□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 HLA-DRB4P13762 266 aa10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF747Q9BV97 191 aa10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.51□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM189A5PLL7 270 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 FAM231BA6NCW3 169 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 KLLNB2CW77 178 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 LEPP41159 167 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 LINC01559Q495D7 138 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.5□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 KNCNA6PVL3 124 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 HIGD1CA8MV81 97 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 GZMBP10144 247 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 AMTNQ6UX39 209 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 NUP35Q8NFH5 326 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 GTSF1Q8WW33 167 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ATRQ13535 2644 aa10.49□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 XKRY2A2RUG3 117 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 J3KRW8 73 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 GPX1P07203 203 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 Q6AWC8 147 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA3Q8NHX4 192 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.48□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 OR11H12B2RN74 326 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 H3BMM0 161 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ORM1P02763 201 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 TSPOP30536 169 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 INSL3P51460 131 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 KIR3DS1Q14943 382 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF124Q15973 351 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.47□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 IGKV3-20P01619 116 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 COX19Q49B96 90 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 Q6ZQT7 251 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.46□□□□□ -0.73
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1B0GXF2 115 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 C7orf71A4D174 169 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 SPINK4O60575 86 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 IGLC6P0CF74 106 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 CDKN1BP46527 198 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 C3orf56Q8N813 242 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 M0R2Z0 102 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 TRGC2P03986 189 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 CTRLP40313 264 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 RAB5BP61020 215 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 WDR73Q6P4I2 378 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 RASL11AQ6T310 242 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF575Q86XF7 245 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.44□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 PHOX2AO14813 284 aa10.43□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 CD7P09564 240 aa10.43□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.43□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 NAGKQ9UJ70 344 aa10.43□□□□□ -0.74
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms