RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1B0GVY2	172 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	KLLN	B2CW77	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	GPX1	P07203	203 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	VGLL1	Q99990	258 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	CCL18	P55774	89 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZTI0	123 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0J9YY99	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	CRISP2	P16562	243 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	HOXA5	P20719	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	PRR9	Q5T870	116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061		Q8TAT8	98 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZQT7	251 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	RGS13	O14921	159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	NMB	P08949	121 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	CSN1S1	P47710	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF138	P52744	262 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061		Q9H3A6	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ILF3-223	ENST00000593061	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	CXorf1	O96002	111 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MUC4	Q99102	2169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	GCHFR	P30047	84 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	RAB5C	P51148	216 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	TCL1A	P56279	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	FHIT	P49789	147 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	SPINK4	O60575	86 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MUC21	Q5SSG8	566 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061		H3BNG1	76 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	IGHV3-53	P01767	116 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	SULT1A2	P50226	295 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	ESRG	Q1W209	222 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061		Q9H8V8	135 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	PGP	A6NDG6	321 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF415	Q09FC8	603 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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