RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591955.1

NPC1-213, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 4

Gene NPC1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-213	ENST00000591955		M0R2P5	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SLC25A20	O43772	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MT-CO3	P00414	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	COX6C	P09669	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MYOD1	P15172	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PRTN3	P24158	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PRDX2	P32119	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF138	P52744	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NXPH1	P58417	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	GNG5	P63218	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LAGE3	Q14657	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PROP1	O75360	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	COX6A1	P12074	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CXCL5	P42830	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	INSL3	P51460	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955		H3BMM0	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	GRP	P07492	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CD7	P09564	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CGB3	P0DN86	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CGB7	P0DN87	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ORM2	P19652	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MDP1	Q86V88	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	ASCL2	Q99929	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-213	ENST00000591955	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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