RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 FOXE3Q13461 319 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TDRG1Q3Y452 100 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 PSMG4Q5JS54 123 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 Q8TAT8 98 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 PRELID3AQ96N28 172 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TPPP3Q9BW30 176 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A096LNT2 108 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 PRAC2D3DTV9 90 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 SOCS3O14543 225 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 MED14OSP0DP75 135 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 HLA-DMBP28068 263 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TWIST1Q15672 202 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 GPHB5Q86YW7 130 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB125Q8N687 156 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM213A2RRL7 107 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 D6R8Y8 96 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 SNAI2O43623 268 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 FSHBP01225 129 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 CKS2P33552 79 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 ERCC8Q13216 396 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 LY6EQ16553 131 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC01545Q5VT33 79 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF575Q86XF7 245 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 AMN1Q8IY45 258 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF182Q8N6D2 247 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF738Q8NE65 137 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 DPF1Q92782 380 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF747Q9BV97 191 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1B0GV90 55 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 OR4C46A6NHA9 309 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 M0QZ24 198 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 TCF21O43680 179 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 HBDP02042 147 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF224P0DH78 156 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 PSMB8P28062 276 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ID1P41134 155 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 BLCAPP62952 87 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZN92 141 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 TEX29Q8N6K0 151 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF185Q96GF1 192 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 SMPXQ9UHP9 88 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV12-3P01733 135 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 CSN3P07498 182 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ELANEP08246 267 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 IGLL1P15814 213 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPOP30536 169 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF843Q8N446 348 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 MRAP2Q96G30 205 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 ODF3Q96PU9 254 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 KLK15Q9H2R5 256 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms