RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 RAXQ9Y2V3 346 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM262E9PQX1 116 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SMKR1H3BMG3 65 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC8Q13216 396 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRD1Q13241 179 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C15orf32Q32M92 178 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 Q5PR19 223 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N9W7 124 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8TAT8 98 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WW49 117 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 NXPH4O95158 308 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UCNP55089 124 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 RIPPLY3P57055 190 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP5G2Q06055 141 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 GLMPQ8WWB7 406 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 USMG5Q96IX5 58 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM17AQ99595 171 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFA4O00483 81 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2D1P51668 147 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8NA96 180 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf92Q96LL3 132 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ODF3Q96PU9 254 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SIRPDQ9H106 197 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF580Q9UK33 172 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 APOMO95445 188 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 AZU1P20160 251 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYBA4P53673 196 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 NDPQ00604 133 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF575Q86XF7 245 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR2DL4Q99706 377 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf86A6NJI1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF815PA8K554 130 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 VCYO14598 125 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PLXNB1O43157 2135 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-69P01742 117 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2D3P61077 147 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2D2P62837 147 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PMVKQ15126 192 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOHQ15669 191 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01600Q96MT4 127 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PRO0461Q9UI25 63 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0J9YX75 114 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 K7ENP7 123 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V0E1O15342 81 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DMBP28068 263 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 ID1P41134 155 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXI1Q12951 378 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR31Q5SQ13 230 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 TEN1Q86WV5 123 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT8Q8NBV8 401 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 BAALCQ8WXS3 180 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC140Q96MF4 163 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-202ENST00000586851 SVILO95425 2214 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-202ENST00000586851 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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