RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584558.5

ITGB4-212, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB4, Length 2,895 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-212ENST00000584558 THAP8Q8NA92 274 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGB4-212ENST00000584558 TMEM160Q9NX00 188 aa9.99□□□□□ -0.81
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ITGB4-212ENST00000584558 PTPN13Q12923 2485 aa9.99□□□□□ -0.81
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ITGB4-212ENST00000584558 OTORQ9NRC9 128 aa9.99□□□□□ -0.81
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ITGB4-212ENST00000584558 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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ITGB4-212ENST00000584558 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGB4-212ENST00000584558 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.91□□□□□ -0.82
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ITGB4-212ENST00000584558 KIR2DL4Q99706 377 aa9.91□□□□□ -0.82
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ITGB4-212ENST00000584558 LINC01549A6NIU2 74 aa9.9□□□□□ -0.82
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ITGB4-212ENST00000584558 H3BVH4 76 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB4-212ENST00000584558 SH2D1AO60880 128 aa9.9□□□□□ -0.82
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