RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.54■□□□□ 0.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZS46 218 aa18.53■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087X0K7 114 aa18.53■□□□□ 0.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGFL4Q6B9Z1 124 aa18.48■□□□□ 0.55
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV3-11P01762 117 aa18.45■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCNL1Q6ZST4 164 aa18.45■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL26Q96S19 204 aa18.45■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FXYD7P58549 80 aa18.45■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM95Q3KNT9 176 aa18.44■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CBY3A6NI87 242 aa18.43■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TWIST1Q15672 202 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa18.43■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CKS2P33552 79 aa18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNG7P62955 275 aa18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR1N2Q8NGR9 330 aa18.41■□□□□ 0.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USMG5Q96IX5 58 aa18.41■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF185Q96GF1 192 aa18.41■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNFNQ9BYD5 112 aa18.41■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa18.4■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSRB1Q9NZV6 116 aa18.4■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.39■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.39■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRI3O95415 125 aa18.39■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV1-40P01703 118 aa18.39■□□□□ 0.53
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