RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAX8Q06710 450 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZQT7 251 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf92Q96LL3 132 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSTL1Q9H114 145 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRORYQ9H606 182 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HBDP02042 147 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTTG1IPP53801 180 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C18orf15Q96N68 181 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL25O15444 150 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV12-3P01733 135 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-69P01742 117 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-11P01762 117 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIEZO1Q92508 2521 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARL3P36405 182 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01559Q495D7 138 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF738Q8NE65 137 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF185Q96GF1 192 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VPS25Q9BRG1 176 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX11Q9Y6N1 276 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXE3Q13461 319 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIFOQ8TCI5 191 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL19Q99731 98 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBAKDNA6NC62 111 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FLNCQ14315 2725 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CACNA1AO00555 2505 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BUX3 64 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNFRSF6BO95407 300 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB1P60022 68 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLK9Q2XQG4 91 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGF1P05019 195 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX8AP10176 69 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5J2P56134 94 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM223BA6NKX1 122 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LEPP41159 167 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VAMP3Q15836 100 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C20orf173Q96LM9 149 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CNFNQ9BYD5 112 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPRY2O43597 315 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PF4V1P10720 104 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BLCAPP62952 87 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLK15Q9H2R5 256 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 U3KQE9 123 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q5PR19 223 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DKK2Q9UBU2 259 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BVH4 76 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZS46 218 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRR9Q5T870 116 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GLMPQ8WWB7 406 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NMUP48645 174 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS1P07477 247 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ACACBO00763 2458 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2V1Q13404 147 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TAX1BP3O14907 124 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.7 ms