RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NCR2O95944 276 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf33Q8WU49 177 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF503Q96F45 646 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 MGST2Q99735 147 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 ABCA1O95477 2261 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 CCL25O15444 150 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 FSHBP01225 129 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 GYPEP15421 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 GNG5P63218 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 Q86TA4 180 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf95Q9H693 158 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 CXCL5P42830 114 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2WQ96B02 151 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf142B7Z368 130 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 IFITM3Q01628 133 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 HERVK_113P63121 156 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 U3KQE9 123 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 H3BQ85 93 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 SCGB1A1P11684 91 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-209ENST00000550857 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DNLZQ5SXM8 178 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 DERL1Q9BUN8 251 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 NIT2Q9NQR4 276 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-209ENST00000550857 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 WT1-ASQ06250 92 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 U3KQK5 164 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 H0YIZ8 118 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 C20orf78Q9BR46 151 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-209ENST00000550857 IGLL1P15814 213 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-209ENST00000550857 FABP2P12104 132 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 CXCL1P09341 107 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DRB4P13762 266 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE6Q13070 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-209ENST00000550857 PLP1P60201 277 aa6.26□□□□□ -1.41
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