RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N7P7 452 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC1Q9HC57 220 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WWL8 130 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 C14orf177Q52M58 125 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 AGMATQ9BSE5 352 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 FSTL3O95633 263 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZSR3 168 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1B-217ENST00000541869 TCTAP57738 103 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TSKUQ8WUA8 353 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 SH2D1AO60880 128 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N9W7 124 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WWC5 75 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PMCHL1Q16048 86 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 VSIRQ9H7M9 311 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE6Q13070 117 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 SMR3AQ99954 134 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TRGC2P03986 189 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 MSMPQ1L6U9 139 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PTPRSQ13332 1948 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGLC1P0CG04 106 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 GPHB5Q86YW7 130 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 H3BRN7 92 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TSPAN13O95857 204 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV1-47P01700 117 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 M0R2P5 195 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PLNP26678 52 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 OCC1Q8TAD7 63 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM126AQ9H061 195 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 K7EMT4 169 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-9P60411 292 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01006Q8NI28 216 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 U3KQE9 123 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087X0M5 115 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GX30 115 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 GYPEP15421 78 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB125Q8N687 156 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0U1RRA0 63 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 SCGB1A1P11684 91 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 COX11Q9Y6N1 276 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 DERL1Q9BUN8 251 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB4AO15263 64 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 Q86TA4 180 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 CIDEAO60543 219 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-39P01597 117 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-39P04432 117 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFA7O95182 113 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 RNF151Q2KHN1 245 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF503Q96F45 646 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 PCP4P48539 62 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1B-217ENST00000541869 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.03□□□□□ -1.12
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