RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR11H12B2RN74 326 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MT-ND6P03923 174 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TYMSP04818 313 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD33P20138 364 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIGQ13278 110 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIGD1CA8MV81 97 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV1-51P01701 117 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CXCL1P09341 107 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRISP2P16562 243 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCL1AP56279 114 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP10-3P60369 221 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAB4BP61018 213 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STHQ8IWL8 128 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNS1Q96KK3 526 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 YPEL4Q96NS1 127 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEU1Q99519 415 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF747Q9BV97 191 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F2Z2F3 143 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F6UB75 175 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMBPP02760 352 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 S100A6P06703 90 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDKN1BP46527 198 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01559Q495D7 138 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NF1P21359 2839 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DRB4P13762 266 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUP35Q8NFH5 326 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FRZBQ92765 325 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TPPP3Q9BW30 176 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GUT8 65 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C7orf71A4D174 169 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 J3KRW8 73 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV3-20P01619 116 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DQA1P01909 254 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRIP1P50238 77 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HBBP68871 147 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAGKQ9UJ70 344 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H3BMM0 161 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK4O60575 86 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KNCNA6PVL3 124 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNURFLB1AK76 121 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLLNB2CW77 178 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASIPP42127 132 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CACNG7P62955 275 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APCSP02743 223 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRGC2P03986 189 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAMPP49913 170 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB1P60022 68 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INSP01308 110 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MED14OSP0DP75 135 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GZMBP10144 247 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms