RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 GGACTQ9BVM4 153 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 POPDC3Q9HBV1 291 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ERGIC3Q9Y282 383 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TIAM1Q13009 1591 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.74□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NESP48681 1621 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 KIF14Q15058 1648 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PTPRDP23468 1912 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C5P01031 1676 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C7orf71A4D174 169 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DISC1C4P0D8 188 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TNFAIP8O95379 198 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CCL2P13500 99 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DYNLT1P63172 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 FXYD3Q14802 87 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 EEA1Q15075 1411 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C8orf74Q6P047 294 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CNBD2Q96M20 576 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 FBXO5Q9UKT4 447 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 OBSL1O75147 1896 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 MYH7BA7E2Y1 1941 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ZFYVE9O95405 1425 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C20orf202A1L168 122 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 H0YIV9 168 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 HMMRO75330 724 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 IGHV3-30P01768 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 IL3P08700 152 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PSMB6P28072 239 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 LCN1P31025 176 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 HBA1P69905 142 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CAV1Q03135 178 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 KLRD1Q13241 179 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 INSL4Q14641 139 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DNM1P34Q6PK57 102 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 OR5AS1Q8N127 324 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 OR5D14Q8NGL3 314 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PBOV1Q9GZY1 135 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 OSTCQ9NRP0 149 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 CMTM6Q9NX76 183 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 NEO1Q92859 1461 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 EVPLLA8MZ36 301 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 LYRM1O43325 122 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 GYPBP06028 91 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 GLRXP35754 106 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 VBP1P61758 197 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 GRK1Q15835 563 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-212ENST00000503501 TOMM6Q96B49 74 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms