RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853		A0A087WWL8	130 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853		E5RGE8	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853		H3BNG1	76 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	PYY	P10082	97 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	CSN1S1	P47710	185 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZTI0	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	THAP6	Q8TBB0	222 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	OR51M1	Q9H341	326 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	OR7C2	O60412	319 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	SIX6	O95475	246 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	NMB	P08949	121 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	CD300C	Q08708	224 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	IL15RA	Q13261	267 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	BTN1A1	Q13410	526 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ESRG	Q1W209	222 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	PAXX	Q9BUH6	204 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	HERC2	O95714	4834 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	KLLN	B2CW77	178 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	PRAF2	O60831	178 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFB4	O95168	129 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	IFNA5	P01569	189 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	OR10J4	P0C629	311 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF138	P52744	262 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	SLA	Q13239	276 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	ASAH1	Q13510	395 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	NMES1	Q9C002	83 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853		Q9H3A6	140 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.21	□□□□□ -1.57
RBM39-238	ENST00000493853	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	SIVA1	O15304	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	SSNA1	O43805	119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	PET100	P0DJ07	73 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	CRISP2	P16562	243 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	TCL1A	P56279	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	TAS2R45	P59539	299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	VGLL1	Q99990	258 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF492	Q9P255	531 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853		A0A096LPF7	62 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	SPINK4	O60575	86 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	UPK1B	O75841	260 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM39-238	ENST00000493853	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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