RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.08■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.08■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.08■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.08■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 IQCJQ1A5X6 159 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 BORCS7Q96B45 105 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 GPX1P07203 203 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 ORM1P02763 201 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZSV7 163 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-211ENST00000492185 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZWC4 215 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 ESM1Q9NQ30 184 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 SYNJ2BPP57105 145 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 PRR9Q5T870 116 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 PRR31Q5SQ13 230 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 TPPP3Q9BW30 176 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 AKAP9Q99996 3911 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 ID1P41134 155 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-211ENST00000492185 C2orf70A6NJV1 201 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 U3KQK5 164 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 DEFB1P60022 68 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 TMEM160Q9NX00 188 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 K7EQG2 157 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 SRD5A1P18405 259 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 AMTP48728 403 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 NIT1Q86X76 327 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 F6UB75 175 aa14.99□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 LINC01619G3V211 115 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZQT7 251 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 RNF114Q9Y508 228 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 SNAI2O43623 268 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 PMCHP20382 165 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 NTF3P20783 257 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 NAGKQ9UJ70 344 aa14.98□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 OR5AL1P0C617 328 aa14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 SLURP1P55000 103 aa14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 ODF3Q96PU9 254 aa14.97□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 KLLNB2CW77 178 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 SCGB2A2Q13296 93 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 DEFB136Q30KP8 78 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 C16orf95Q9H693 158 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 MTORP42345 2549 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.96□□□□□ -0.01
NELFE-211ENST00000492185 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 HSBP1O75506 76 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 TWIST1Q15672 202 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 MUC21Q5SSG8 566 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 AMN1Q8IY45 258 aa14.96□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 CD33P20138 364 aa14.95□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.95□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.95□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.95□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 Q8N976 141 aa14.94□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 OR11H1Q8NG94 326 aa14.94□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 RNF185Q96GF1 192 aa14.94□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 A0A0J9YX75 114 aa14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 M0QZ24 198 aa14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 SCGB1D1O95968 90 aa14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 PKIAP61925 76 aa14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.93□□□□□ -0.02
NELFE-211ENST00000492185 LINC00587B1AMM8 73 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms