RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01587Q99440 93 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 B9D2Q9BPU9 175 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 VWFP04275 2813 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM189A5PLL7 270 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C9JCJ5 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 J3KRW8 73 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 GCGP01275 180 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 CENPWQ5EE01 88 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 COMMD7Q86VX2 200 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 Q8TAT8 98 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 PARLQ9H300 379 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00862A6NCI5 91 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 KLLNB2CW77 178 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 MIFP14174 115 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 FXYD7P58549 80 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB1P60022 68 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RRN3P1Q2M238 152 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB135Q30KP9 77 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 AMTNQ6UX39 209 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 RNF183Q96D59 192 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SGK494Q96LW2 274 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 NAT8Q9UHE5 227 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-210ENST00000486889 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 CBY3A6NI87 242 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SFTA3P0C7M3 94 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 HTN1P15515 57 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 Q6AWC8 147 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 OR11H2Q8NH07 326 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00479Q96M42 142 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 NEU1Q99519 415 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SNURFLB1AK76 121 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 F8W036 122 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV2-11P01706 119 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 P01737 135 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ORM1P02763 201 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 OR5I1Q13606 314 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 PRR27Q6MZM9 219 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 C16orf74Q96GX8 76 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 NAGKQ9UJ70 344 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R2P9O14990 202 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ERVFC1-1P60608 527 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 BTN1A1Q13410 526 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 C8orf49Q96NF6 230 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 DERL1Q9BUN8 251 aa7.12□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 B4DEV8 164 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ASIPP42127 132 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF415Q09FC8 603 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ADIRFQ15847 76 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 IL17DQ8TAD2 202 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 BORCS7Q96B45 105 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TVP23CQ96ET8 276 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SEC11CQ9BY50 192 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM218A2RU14 115 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 MT-ND4LP03901 98 aa7.1□□□□□ -1.27
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