RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.45□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 Q86TA4 180 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RNF183Q96D59 192 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 FMC1Q96HJ9 113 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.45□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 BTN1A1Q13410 526 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RCHY1Q96PM5 261 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 SPATA25Q9BR10 227 aa7.44□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 C7orf71A4D174 169 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 C9JQL5 133 aa7.43□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.43□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 TREM1Q9NP99 234 aa7.43□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM250H0YL14 139 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 X6R8D5 127 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.41□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 PEA15Q15121 130 aa7.41□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 PARLQ9H300 379 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 GCGP01275 180 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV2-8P01709 118 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 BAGE2Q86Y30 109 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.4□□□□□ -1.22
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GARNL3-211ENST00000460176 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 C9JCJ5 164 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 H7BYZ3 331 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 PRM2P04554 102 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 GNG4P50150 75 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 CRIP1P50238 77 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 CEBPGP53567 150 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 Q8NAQ8 132 aa7.39□□□□□ -1.23
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GARNL3-211ENST00000460176 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00862A6NCI5 91 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 MIFP14174 115 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 AZU1P20160 251 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM12Q96EX1 92 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 SH2D1AO60880 128 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-211ENST00000460176 RRN3P1Q2M238 152 aa7.37□□□□□ -1.23
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