RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA3O95167 84 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SRD5A1P18405 259 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP8Q8NA92 274 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf49Q96NF6 230 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP250Q9BV73 2442 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CRLF1O75462 422 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf56Q8N813 242 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BS24 57 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SNCGO76070 127 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 APELAP0DMC3 54 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C4orf26Q17RF5 130 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINK14Q6IE38 97 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCAMO60469 2012 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MWV9 139 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 IFITM1P13164 125 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DRB4P13762 266 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf77Q96MU5 243 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM262E9PQX1 116 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5LO75964 103 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 LYZP61626 148 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HCP5Q6MZN7 132 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TCL1BO95988 128 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 PROCRQ9UNN8 238 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HES7Q9BYE0 225 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R3E3 92 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM201AQ5SY85 155 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZQT7 251 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 LYZL6O75951 148 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D1AO60880 128 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 OXTP01178 125 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV1-44P01699 117 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CGB3P0DN86 165 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CGB7P0DN87 165 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2D3P61077 147 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2D2P62837 147 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CADP27708 2225 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00477Q96M19 166 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPI3 338 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 EFNA4P52798 201 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF185Q96GF1 192 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV9Q99603 122 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRM5B3KS81 715 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRNQ5BIV9 151 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSZQ9UBR2 303 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3-15P01624 115 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2D1P51668 147 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 C9JAW5 83 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms