RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ITPR2Q14571 2701 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MWP6 167 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ORM1P02763 201 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 BMI1P35226 326 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00310P59036 64 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IQCJQ1A5X6 159 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF738Q8NE65 137 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NOTCH2Q04721 2471 aa3.03□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GUT8 65 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB1P60022 68 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf173Q96LM9 149 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RCHY1Q96PM5 261 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SMPXQ9UHP9 88 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF580Q9UK33 172 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RBAKDNA6NC62 111 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF138P52744 262 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RIGQ13278 110 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GPHB5Q86YW7 130 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 BORCS7Q96B45 105 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 NRN1Q9NPD7 142 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM89A2RUT3 159 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ELANEP08246 267 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PMCHP20382 165 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TFPI2P48307 235 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNJ2BPP57105 145 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PAFAH1B2P68402 229 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXE3Q13461 319 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 F6UB75 175 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EMT4 169 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SCGB1D1O95968 90 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 MED14OSP0DP75 135 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 NTF3P20783 257 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 AMTP48728 403 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZD2O15018 2839 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WW49 117 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM213A2RRL7 107 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 M0QZ24 198 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SOCS3O14543 225 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GPX1P07203 203 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ESDP10768 282 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB136Q30KP8 78 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LCE3BQ5TA77 95 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6AWC8 147 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZQT7 251 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 MTORP42345 2549 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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LRRTM4-201ENST00000409088 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TWIST1Q15672 202 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZWC4 215 aa3.01□□□□□ -1.93
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LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SORL1Q92673 2214 aa3.01□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 OVOL1O14753 267 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CTAG1AP78358 180 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 S100A12P80511 92 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 NIT1Q86X76 327 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF575Q86XF7 245 aa3□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX29Q8N6K0 151 aa3□□□□□ -1.93
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