RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC140Q96MF4 163 aa12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 Q6AWC8 147 aa12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.65□□□□□ -0.38
SHQ1-201ENST00000325599 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 BUB3O43684 328 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 OR5AL1P0C617 328 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.64□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GW15 77 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SCGB2A1O75556 95 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SMIM17P0DL12 118 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 GATA3P23771 443 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 FXYD7P58549 80 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 KIR3DS1Q14943 382 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PET117Q6UWS5 81 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 NPFFO15130 113 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 GNLYP22749 145 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SMKR1H3BMG3 65 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 FA2HQ7L5A8 372 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.63□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SEC11AP67812 179 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 NCR2O95944 276 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TWIST1Q15672 202 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SPG11Q96JI7 2443 aa12.62□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 H3BRM9 83 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ORM1P02763 201 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PRELID3AQ96N28 172 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF747Q9BV97 191 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 A0A096LNJ9 63 aa12.61□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 A6NDN8 102 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV4-39P01824 125 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PPIFP30405 207 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ATP5G2Q06055 141 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.6□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PPM0 123 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MRAP2Q96G30 205 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 U3KQK5 164 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 IGLC6P0CF74 106 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TM4SF20Q53R12 229 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ORMDL3Q8N138 153 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF479Q96JC4 524 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.59□□□□□ -0.39
SHQ1-201ENST00000325599 GAS8-AS1O95177 125 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 NPYP01303 97 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 FABP2P12104 132 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01545Q5VT33 79 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PRORYQ9H606 182 aa12.58□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PKD1L2Q7Z442 2459 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CKS2P33552 79 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 KLK9Q2XQG4 91 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZQT7 251 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.57□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 COX8AP10176 69 aa12.56□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.56□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PIFOQ8TCI5 191 aa12.56□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.56□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 HERV-K104P63124 156 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 MTURNQ8N3F0 131 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 WFDC2Q14508 124 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 METTL26Q96S19 204 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PAX8Q06710 450 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RNF185Q96GF1 192 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.55□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV41A0A0B4J266 112 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 ETDBQ3ZM63 59 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SAMD5Q5TGI4 173 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.54□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12.53□□□□□ -0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 30
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV12-3P01733 135 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms