RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-201ENST00000283228 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
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PTPRR-201ENST00000283228 CTSZQ9UBR2 303 aa8.91□□□□□ -0.98
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PTPRR-201ENST00000283228 SHISA9B4DS77 424 aa8.91□□□□□ -0.98
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PTPRR-201ENST00000283228 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 HERVK_113P61574 105 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 PCSK5Q92824 1860 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 ID1P41134 155 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 PRAC2D3DTV9 90 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 I3L2K1 104 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 IGLC6P0CF74 106 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF56Q15929 161 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.84□□□□□ -0.99
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