RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 THYN1Q9P016 225 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3-20P01619 116 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 LMO4P61968 165 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 Q8N6K4 173 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 C20orf173Q96LM9 149 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 COX11Q9Y6N1 276 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 BUB3O43684 328 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 M0R1W7 72 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-39P01824 125 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 ORMDL3Q8N138 153 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 H3BVH4 76 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 M0R381 172 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 USP24Q9UPU5 2620 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 C7orf71A4D174 169 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 TAX1BP3O14907 124 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 S100A7P31151 101 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 LEPP41159 167 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 EFNA4P52798 201 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 RNF185Q96GF1 192 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 NPFFO15130 113 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 PAX2Q02962 417 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 RNF5Q99942 180 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GINS1-201ENST00000262460 ZNF738Q8NE65 137 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 SMIM12Q96EX1 92 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 DUX5Q96PT3 197 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 NOTCH2Q04721 2471 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 LINC01545Q5VT33 79 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 DTX2Q86UW9 622 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 C16orf92Q96LL3 132 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 AVPP01185 164 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PRB1P04280 392 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PRSS1P07477 247 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PSG9Q00887 426 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 K7ERJ3 54 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PF4V1P10720 104 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 EMP1P54849 157 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 H3BUX3 64 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 GNRH2O43555 120 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TNFRSF6BO95407 300 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 UBE2E1P51965 193 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 JPT2Q9H910 190 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 GOSR1O95249 250 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PET117Q6UWS5 81 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PIFOQ8TCI5 191 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FOXC2Q99958 501 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ST20Q9HBF5 79 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TMEM160Q9NX00 188 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FAM231BA6NCW3 169 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PRM2P04554 102 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 UBE2V1Q13404 147 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 IGLC6P0CF74 106 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ATP5G2Q06055 141 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PDE6HQ13956 83 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.62□□□□□ -1.35
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