RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav23A0A0G2JG17 115 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp977L7N2E7 438 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sult1a1P52840 291 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa10.75□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp38A8R0X1 80 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10073E9Q3T0 114 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34c3J3QJW5 233 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adrb3P25962 400 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec11cQ9D8V7 192 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prok2Q9QXU7 128 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700031F05RikB1AX30 191 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AvpP35455 168 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkn1aP39689 159 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnd3P61588 244 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldlrad2Q3V0V0 142 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HaaoQ78JT3 286 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8VC23 124 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lypd8Q9D7S0 255 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exph5Q0VAV2 1960 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28845A0A087WR76 214 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm37797A0A1D5RLC8 261 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21882J3QN86 361 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NgfP01139 241 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ins1P01325 108 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pafah1b2Q61206 229 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr101Q920Z0 308 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CenpvQ9CXS4 252 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srsf10Q9R0U0 262 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alms1Q8K4E0 3251 aa10.74□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp931A2AHM2 298 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldlrad3A2AR95 345 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr747E9PXH6 313 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr920E9Q413 310 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrhQ8CIT0 187 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc17a9Q8VCL5 447 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo9bQ9QY06 2114 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r194J3JS27 296 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam3dP97805 223 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr917Q7TRC3 309 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr218E9PWV2 313 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34c2J3QNM1 233 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps21P58059 87 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lsm11Q8BUV6 361 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34c1Q8K193 234 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RfxapQ8VCG9 231 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sft2d3Q9CSV6 209 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrc5C3VPR6 1915 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt10P0C027 164 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt11P0C028 164 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9DAF8 208 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RprmQ9JJ72 109 aa10.73□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plxna2P70207 1894 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12830F6XVH0 157 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist1h3aP68433 136 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gfra1P97785 468 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trat1Q3UU67 187 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3UZV7 1028 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ypel2Q65Z95 119 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnd1Q6VY05 352 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ypel1Q9ESC7 118 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arfgef3Q3UGY8 2170 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ElnP54320 860 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F2rl1P55086 399 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9047B9EJX3 177 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrx2Q06348 247 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SrstQ06666 185 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il31Q6EAL8 163 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbln2Q8BGU2 224 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgst3Q9CPU4 153 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr23a3Q9CWP9 254 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sptbn4E9PX29 2561 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14408E9Q6B9 136 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 G530012D18RikJ3QK25 139 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KncnQ307W7 124 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 6030452D12RikQ8CD33 222 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MavsQ8VCF0 503 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkg7Q99PA5 165 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa10.72□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14412A2ARR7 526 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam6aB2RSY5 754 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1537P34983 314 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B1ARW8 110 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp420Q7TMN8 578 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eda2rQ8BX35 297 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem230Q8CIB6 120 aa10.71□□□□□ -0.69
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AsmtD3KU66 387 aa10.71□□□□□ -0.7
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr143P34985 313 aa10.71□□□□□ -0.7
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CortP56469 109 aa10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms