RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 FHL3Q13643 280 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 DKK1O94907 266 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 ORM1P02763 201 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 UTF1Q5T230 341 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RAB9BQ9NP90 201 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.19□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 KLRB1Q12918 225 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 Q1RN00 199 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.18□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM27E3Q08E93 113 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 TAL2Q16559 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.18□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 LOXL3P58215 753 aa7.17□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 M0QXV9 152 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 M0R3E3 92 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZT83 130 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC01548A6NM66 108 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 PF4V1P10720 104 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM201AQ5SY85 155 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RAX2Q96IS3 184 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF815PA8K554 130 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 FRYQ5TBA9 3013 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 C8orf49Q96NF6 230 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 K7EM74 188 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV1-2P23083 117 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZS92 163 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 CCL17Q92583 94 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-210ENST00000625282 K7ENP7 123 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 RHODO00212 210 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 WISP2O76076 250 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 CD3EP07766 207 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 WT1-ASQ06250 92 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-210ENST00000625282 LRP4O75096 1905 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ADAMTS20P59510 1910 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 E7EUB6 86 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TNFRSF6BO95407 300 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 PLGLAQ15195 96 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 AJUBAQ96IF1 538 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C17orf77Q96MU5 243 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A20O43772 301 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 EFNA4P52798 201 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 REV3LO60673 3130 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CCL8P80075 99 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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