RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CARD19Q96LW7 228 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 DSCAMO60469 2012 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf65H3BRN8 121 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 EVI2AP22794 236 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CD69Q07108 199 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 RRN3P1Q2M238 152 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TEX29Q8N6K0 151 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SPRY4Q9C004 299 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 Q9H3A6 140 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TCRAP04437 139 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LYNX1P0DP58 116 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 RIGQ13278 110 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 DPF1Q92782 380 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PRNDQ9UKY0 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 M0R1B8 84 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PF4V1P10720 104 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FOXC1Q12948 553 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CITED1Q99966 193 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF785A8K8V0 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 OVOL3O00110 214 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FAM27E3Q08E93 113 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ODF1Q14990 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MSMPQ1L6U9 139 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LEPP41159 167 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 DLL1O00548 723 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA3O95167 84 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CKS2P33552 79 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HCP5Q6MZN7 132 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 Q86TA4 180 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C17orf77Q96MU5 243 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CALYQ9NYX4 217 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CRLF1O75462 422 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ARL3P36405 182 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MYCNOSP40205 109 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5J2P56134 94 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF492Q9P255 531 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01549A6NIU2 74 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGKCP01834 107 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CRYGCP07315 174 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PRCDQ00LT1 54 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PROCRQ9UNN8 238 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV3-15P01624 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ORMDL3Q8N138 153 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf49Q96NF6 230 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FSTL3O95633 263 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-DRB4P13762 266 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CCL8P80075 99 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MZT1Q08AG7 82 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FMC1Q96HJ9 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HARBI1Q96MB7 349 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE12JA6NER3 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 M0R3E3 92 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 UPK2O00526 184 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE7O76087 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE12FP0CL80 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE12GP0CL81 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE12IP0CL82 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CRIP1P50238 77 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LOXL3P58215 753 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE4Q13068 117 aa6.46□□□□□ -1.37
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