RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 NIT2Q9NQR4 276 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 NDUFA4O00483 81 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GNG7O60262 68 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 SCGB2A1O75556 95 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CTSGP08311 255 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 PYY3Q5JQD4 70 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 LEMD1Q68G75 181 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 BAGE2Q86Y30 109 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 BLNKQ8WV28 456 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ATG101Q9BSB4 218 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 Q9H3A6 140 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 OTORQ9NRC9 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 RNF24Q9Y225 148 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 A8MWP6 167 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TCRAP04437 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CSN3P07498 182 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-217ENST00000611848 ADMP35318 185 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 KRTAP10-11P60412 298 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GNG5P63218 68 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 COX19Q49B96 90 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 RNF125Q96EQ8 232 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 FMC1Q96HJ9 113 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GPR82Q96P67 336 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MLST8Q9BVC4 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 C2orf70A6NJV1 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 LTAP01374 205 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IGLV1-51P01701 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 AMBPP02760 352 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IGLC2P0DOY2 106 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CBLN1P23435 193 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 UBE2G1P62253 170 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 S100A7AQ86SG5 101 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 NUDT11Q96G61 164 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM213A2RRL7 107 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 K7EMT4 169 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MT-ND6P03923 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IL4P05112 153 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 WDR73Q6P4I2 378 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.67□□□□□ -1.34
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SMAD4-217ENST00000611848 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 H3BTX0 84 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 RASL11AQ6T310 242 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF492Q9P255 531 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 SNURFLB1AK76 121 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 IGLV2-11P01706 119 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ESDP10768 282 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 Q0VG73 95 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 PDE6HQ13956 83 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CT83Q5H943 113 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 LCN12Q6JVE5 192 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM18Q96B42 140 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-217ENST00000611848 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-217ENST00000611848 TCL1AP56279 114 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-217ENST00000611848 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-217ENST00000611848 Q86TA4 180 aa6.65□□□□□ -1.35
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