RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AJUBAQ96IF1 538 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITPR1Q14643 2758 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GW15 77 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHG4P01861 327 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FXYD7P58549 80 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TWIST1Q15672 202 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRAC2D3DTV9 90 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMKR1H3BMG3 65 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOSR1O95249 250 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BMI1P35226 326 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZVH6 145 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRELID3AQ96N28 172 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPFFO15130 113 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNLYP22749 145 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC140Q96MF4 163 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM238C9JI98 176 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BUB3O43684 328 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCR2O95944 276 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 S100A7P31151 101 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PET117Q6UWS5 81 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ORMDL3Q8N138 153 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CKS2P33552 79 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFS8O00217 210 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ST20Q9HBF5 79 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF151Q2KHN1 245 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GATD1Q8NB37 220 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF747Q9BV97 191 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CBY3A6NI87 242 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-39P01824 125 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCTAP57738 103 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 METTL26Q96S19 204 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EP13 123 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNAI2O43623 268 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPYP01303 97 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5G2Q06055 141 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MPV17L2Q567V2 206 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPBPP02775 128 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAB9AP51151 201 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01545Q5VT33 79 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A096LNJ9 63 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LY6EQ16553 131 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUDT3O95989 172 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLC6P0CF74 106 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF575Q86XF7 245 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 U3KQK5 164 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAS8-AS1O95177 125 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV3P03979 118 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERASQ7Z444 233 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087X0K7 114 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3KRW8 73 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EVI2AP22794 236 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CACNG7P62955 275 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms