RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 UPK3BQ9BT76 320 aa7.45□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 Q9H8V8 135 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 PYYP10082 97 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 CRISP2P16562 243 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ERCC8Q13216 396 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.44□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.44□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.42□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.42□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 H0YIZ8 118 aa7.41□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.4□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.4□□□□□ -1.22
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PDXDC1-211ENST00000565362 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-211ENST00000565362 FAT1Q14517 4588 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-211ENST00000565362 PRAF2O60831 178 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-211ENST00000565362 ENKURQ8TC29 256 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-211ENST00000565362 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-211ENST00000565362 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 RGS13O14921 159 aa7.37□□□□□ -1.23
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PDXDC1-211ENST00000565362 H2BFSP57053 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.37□□□□□ -1.23
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