RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GVG6	124 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	HMSD	A8MTL9	139 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC179	H3BU77	68 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PITX3	O75364	302 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CD2	P06729	351 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFA4	P12838	97 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	RELA	Q04206	551 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD52	Q0P140	79 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CLLU1	Q5K131	121 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOS	Q8NHW6	89 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MUCL1	Q96DR8	90 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH10	P35580	1976 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN1A	P35498	2009 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	GLI3	P10071	1580 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN4A	P35499	1836 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R233	179 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	UBL3	O95164	117 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2D-28	P01615	120 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CKS2	P33552	79 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBD1	P61457	104 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q56UQ5	140 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6AWC8	147 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZTI0	123 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CUL7	Q14999	1698 aa		1.55	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		B4DSR2	109 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAPC5	O75971	98 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CRP	P02741	224 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MOBP	Q13875	183 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	GKN2	Q86XP6	184 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CST11	Q9H112	138 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL26	Q9Y258	94 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	STRC	Q7RTU9	1775 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SLX4	Q8IY92	1834 aa		1.54	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		J3QLW9	94 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRL2	O95490	1459 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	APOC2	P02655	101 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CATR1	Q13166	79 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE6H	Q13956	83 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB134	Q4QY38	66 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf73	Q69YU5	71 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC11C	Q9BY50	192 aa		1.53	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO10	Q9HD67	2058 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRS	Q13332	1948 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	USP54	Q70EL1	1684 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		1.52	□□□□□ -2.17

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