RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SEC11AP67812 179 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ERCC8Q13216 396 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PPP1R1AQ13522 171 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PMCHL1Q16048 86 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TAL2Q16559 108 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR2T5Q6IEZ7 315 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR1L8Q8NGR8 309 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR2T29Q8NH02 315 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR10D3Q8NH80 312 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TWIST2Q8WVJ9 160 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF488Q96MN9 340 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SPIN2AQ99865 258 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.85□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ABCA4P78363 2273 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM212A6NML5 194 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM250H0YL14 139 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CCDC179H3BU77 68 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HLA-DRB1P01911 266 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 TTRP02766 147 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HLA-DPB1P04440 258 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 LINC00032P0C843 101 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CCL3P10147 92 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SLC25A6P12236 298 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CDK2P24941 298 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR1E2P47887 323 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 GNG5P63218 68 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HLA-DRB3P79483 266 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 EBI3Q14213 229 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CLEC12BQ2HXU8 276 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 RPEL1Q2QD12 228 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 MPV17LQ2QL34 196 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HLA-DRB5Q30154 266 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 C1orf195Q5TG92 126 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 Q6Q795 121 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 RASL11AQ6T310 242 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 LCN15Q6UWW0 184 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 Q6ZR03 302 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 Q6ZT83 130 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 Q6ZUT4 128 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF550Q7Z398 422 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 VN1R4Q7Z5H5 301 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR4C13Q8NGP0 309 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 OR4C12Q96R67 309 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 RERGLQ9H628 205 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 REEP1Q9H902 201 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 RPRMQ9NS64 109 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 PRNDQ9UKY0 176 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 MED31Q9Y3C7 131 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.84□□□□□ -1.95
PRPF39-212ENST00000557477 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.84□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 SCN2AQ99250 2005 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 A0A0A6YYD5 115 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 F8W1H4 67 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF682O95780 498 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 REG1AP05451 166 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 IL3P08700 152 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 LINC00694P0DN24 101 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 IFITM1P13164 125 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 CRYBB3P26998 211 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 CAV3P56539 151 aa2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PRPF39-212ENST00000557477 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms