RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	DPM2	O94777	84 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGHV3-7	P01780	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGLC6	P0CF74	106 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ADCYAP1	P18509	176 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CXCL3	P19876	107 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BO	P23527	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BB	P33778	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BD	P58876	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF146	Q15072	292 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	LEAP2	Q969E1	77 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	FMC1	Q96HJ9	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPIN2A	Q99865	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	THTPA	Q9BU02	230 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	PARP11	Q9NR21	331 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A1W2PP11	408 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ODAM	A1E959	279 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CATR1	Q13166	79 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IL15RA	Q13261	267 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	XAF1	Q6GPH4	301 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	LRTM2	Q8N967	370 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	OTOS	Q8NHW6	89 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IMMP2L	Q96T52	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	BCL2	P10415	239 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CXCL2	P19875	107 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CTRL	P40313	264 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	H2BFS	P57053	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	MMD	Q15546	238 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q5XG85	94 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	DEFB125	Q8N687	156 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	FRZB	Q92765	325 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A0J9YWU9	116 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		A6NIN4	97 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		F5H697	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TNFSF12	O43508	249 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRIAP1	O43715	76 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CXorf1	O96002	111 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CA2	P00918	260 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	SEC11B	P0C7V7	166 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CGB3	P0DN86	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CGB7	P0DN87	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CRYBB3	P26998	211 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q8IYB0	196 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC01587	Q99440	93 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	NRN1	Q9NPD7	142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	CALY	Q9NYX4	217 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRR32	B1ATL7	298 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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