RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 A6NDN8 102 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PLP1P60201 277 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 HSD52Q0P140 79 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CFAP161Q6P656 301 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FAM222BQ8WU58 562 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 C8orf49Q96NF6 230 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 M0R3E3 92 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GAS8-AS1O95177 125 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CSN1S1P47710 185 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 APCP25054 2843 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 COX7A1P24310 79 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 MZT1Q08AG7 82 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 MTURNQ8N3F0 131 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CRYGCP07315 174 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 AZU1P20160 251 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GCSHP23434 173 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 NDUFB3O43676 98 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SCGB1A1P11684 91 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 KLRD1Q13241 179 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 RIGQ13278 110 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 OTORQ9NRC9 128 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 NPYP01303 97 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PAX8Q06710 450 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 Q5PR19 223 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PRELID3AQ96N28 172 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TRGV9Q99603 122 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SMPXQ9UHP9 88 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PSG3Q16557 428 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 S4R3C0 116 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CREBBPQ92793 2442 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 FABP2P12104 132 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PSG8Q9UQ74 426 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CEACAM3P40198 252 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 GATD1Q8NB37 220 aa7.14□□□□□ -1.27
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THBS3-211ENST00000541990 RAB9BQ9NP90 201 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MTORP42345 2549 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 HBDP02042 147 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 WFDC2Q14508 124 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 DPF1Q92782 380 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 RBP4P02753 201 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-39P01824 125 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SMIM17P0DL12 118 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 AMTNQ6UX39 209 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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