RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-204ENST00000538708 U3KQE9 123 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-204ENST00000538708 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 PRR25Q96S07 402 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 PI4KAP42356 2102 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 CACNA1BQ00975 2339 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 C5orf30Q96GV9 206 aa7.42□□□□□ -1.22
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