RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MLST8Q9BVC4 326 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL36BQ9NZH7 164 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOCS3O14543 225 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV2-11P01706 119 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV2-8P01709 118 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR25Q96S07 402 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIVEP1P15822 2718 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EQG2 157 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DMBP28068 263 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPOP30536 169 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX19Q49B96 90 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CT83Q5H943 113 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMG4Q5JS54 123 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCANP1Q8TF63 244 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BORCS7Q96B45 105 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUDT11Q96G61 164 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VGLL1Q99990 258 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFHX3Q15911 3703 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAP30O75446 220 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ELOBQ15370 118 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM210BQ96KR6 192 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F8P00451 2351 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PPQ1 181 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM189A5PLL7 270 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM231BA6NCW3 169 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COLCA2A8K830 154 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF688P0C7X2 276 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAB5AP20339 215 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LEPP41159 167 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INSL3P51460 131 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERCC8Q13216 396 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6AWC8 147 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSKUQ8WUA8 353 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 V9GYV3 84 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRAC2D3DTV9 90 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPX1P07203 203 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C20orf173Q96LM9 149 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ODF3Q96PU9 254 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 S100A8P05109 93 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EDN2P20800 178 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAB5BP61020 215 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR73Q6P4I2 378 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C3orf56Q8N813 242 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8TAT8 98 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ORM1P02763 201 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C8orf49Q96NF6 230 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CITED1Q99966 193 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0J9YX75 114 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GW15 77 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH2D1AO60880 128 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB131AP59861 70 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RASL11AQ6T310 242 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms