RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 C7orf71A4D174 169 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 C5orf51A6NDU8 294 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SIVA1O15304 175 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 S100A11P31949 105 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP10-2P60368 255 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 C18orf15Q96N68 181 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 FUT9Q9Y231 359 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CCSO14618 274 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 PAX4O43316 350 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MPDU1O75352 247 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 GPX1P07203 203 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 BAXQ07812 192 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ERCC8Q13216 396 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SLAQ13239 276 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.28□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 M0R3E3 92 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NMBP08949 121 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IL7P13232 177 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 BTCP35070 178 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 SULT1A1P50225 295 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00315P59091 139 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 HBG1P69891 147 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 HBG2P69892 147 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 CD300CQ08708 224 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 PDE6HQ13956 83 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ATP6V1FQ16864 119 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 STX12Q86Y82 276 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf50Q96LR7 162 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.27□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 KLLNB2CW77 178 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RGS13O14921 159 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK4O60575 86 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 BTN1A1Q13410 526 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 VWC2Q2TAL6 325 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 BLNKQ8WV28 456 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 PRO0255Q9UI72 69 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.26□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 EPM2AB3EWF7 344 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NXPH4O95158 308 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFB4O95168 129 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TCRBP04435 133 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 FGF7P21781 194 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TCL1AP56279 114 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ERVFC1-1P60608 527 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 S100A10P60903 97 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NFE4Q86UQ8 179 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 PLA2G10O15496 165 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 LYRM1O43325 122 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 PYYP10082 97 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 CRISP2P16562 243 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ICAM4Q14773 271 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.24□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 PRAF2O60831 178 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IFNA5P01569 189 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-53P01767 116 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.23□□□□□ -1.09
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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