RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 QRFPP83859 136 aa0□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 DIRC1Q969H9 104 aa0□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 NAT8BQ9UHF3 227 aa0□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 NINQ8N4C6 2090 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 ANK2Q01484 3957 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 LY6G6CO95867 125 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 MT-ND6P03923 174 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 FABP4P15090 132 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 GLRXP35754 106 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 CAV3P56539 151 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 POU6F1Q14863 301 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 MCEEQ96PE7 176 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 IL20Q9NYY1 176 aa-0.01□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TECPR2O15040 1411 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 H3BQV1 296 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TAS2R41P59536 307 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 NEDD8Q15843 81 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 CASC2Q6XLA1 102 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 NEK7Q8TDX7 302 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 AP3S1Q92572 193 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 STOML2Q9UJZ1 356 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 UFC1Q9Y3C8 167 aa-0.02□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.03□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 XAF1Q6GPH4 301 aa-0.03□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
ITGA4-211ENST00000490435 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 H7BYZ3 331 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 SULT1C4O75897 302 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TRACP01848 142 aa-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 OR4B1Q8NGF8 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TCTAP57738 103 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 SPINK13Q1W4C9 94 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 STX19Q8N4C7 294 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 OR5AK2Q8NH90 309 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CLEC2BQ92478 149 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 MED11Q9P086 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 SYNMO15061 1565 aa-0.06□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM238C9JI98 176 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 GABARAPH6UMI1 98 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 GYPBP06028 91 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 FABP2P12104 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 EVI2AP22794 236 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA6P56556 154 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CROCCP2Q86T23 111 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 ESPL1Q14674 2120 aa-0.07□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 IGF2RP11717 2491 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CRYBA4P53673 196 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 FXYD3Q14802 87 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 CACNA1HO95180 2353 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.08□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 FGD6Q6ZV73 1430 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM229BQ8NBD8 167 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 383.1 ms