RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488814.5

FUBP1-210, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 3

Gene FUBP1, Length 612 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-210	ENST00000488814	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	OVOL1	O14753	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TCF21	O43680	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	NDUFA7	O95182	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TYMS	P04818	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	COX19	Q49B96	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	CT83	Q5H943	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FUBP1-210	ENST00000488814	POLQ	O75417	2590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814		A8MWL6	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TRGC2	P03986	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ZNF138	P52744	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TCL1A	P56279	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814		Q8TAT8	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	PRR25	Q96S07	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SOCS3	O14543	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	CD28	P10747	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	CBLN1	P23435	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ERCC8	Q13216	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	FRZB	Q92765	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	NEU1	Q99519	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ASCL2	Q99929	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	VGLL1	Q99990	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814		A0A1W2PRX2	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SPINK4	O60575	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SH2D1A	O60880	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	CRLF1	O75462	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	MT-ND6	P03923	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	EDN2	P20800	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	TFPI2	P48307	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	RAB4B	P61018	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814		Q6AWC8	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-210	ENST00000488814	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.3 ms