RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.14□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa2.14□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PTPRFP10586 1907 aa2.14□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PLA2R1Q13018 1463 aa2.14□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 HELZP42694 1942 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C7orf66A4D0T2 115 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 A8MWL6 223 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 OOSP1A8MZH6 123 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 HYPMO75409 117 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CXCL1P09341 107 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CISD3P0C7P0 127 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PTHLHP12272 177 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 COX7CP15954 63 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 AKR1C1Q04828 323 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 MPV17L2Q567V2 206 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C3orf56Q8N813 242 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LINC01600Q96MT4 127 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 EPDR1Q9UM22 224 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ABCC5O15440 1437 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PTPRDP23468 1912 aa2.13□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SCN9AQ15858 1988 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 BTAF1O14981 1849 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CFAP43Q8NDM7 1665 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 DSCAMO60469 2012 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 DOCK1Q14185 1865 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 MON2Q7Z3U7 1717 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C10orf71Q711Q0 1435 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SVILO95425 2214 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TMEM223A0PJW6 202 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 A6NN06 94 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C3orf84H3BNL1 204 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SFT2D2O95562 160 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGKV2D-28P01615 120 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TRACP01848 142 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CD3DP04234 171 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGKV1-16P04430 117 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CCL5P13501 91 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 FABP4P15090 132 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 CSN1S1P47710 185 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 LINC00315P59091 139 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 HMGN3Q15651 99 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 Q5W150 140 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C12orf73Q69YU5 71 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SLC25A26Q70HW3 274 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 DYNAPQ8N1N2 210 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ZNF645Q8N7E2 425 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RGPD2P0DJD1 1756 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 COL18A1P39060 1754 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SCN11AQ9UI33 1791 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 KIF14Q15058 1648 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IQGAP3Q86VI3 1631 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 ADCY10Q96PN6 1610 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 GOLGA3Q08378 1498 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 NLRP1Q9C000 1473 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 DISP1Q96F81 1524 aa2.12□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 COL1A2P08123 1366 aa2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 RGPD1P0DJD0 1748 aa2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 KDM3BQ7LBC6 1761 aa2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 MADDQ8WXG6 1647 aa2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.11□□□□□ -2.07
PHC3-211ENST00000486042 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms