RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC32Q9BV29 185 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 KLLNB2CW77 178 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 PLA2G10O15496 165 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 M0R3E3 92 aa15.27■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 NUDT15Q9NV35 164 aa15.27■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PRO0255Q9UI72 69 aa15.2■□□□□ 0.02
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PTPRN-215ENST00000484986 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.18■□□□□ 0.02
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PTPRN-215ENST00000484986 ZNF492Q9P255 531 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTPRN-215ENST00000484986 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 OR51M1Q9H341 326 aa15.16■□□□□ 0.02
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PTPRN-215ENST00000484986 ZNF415Q09FC8 603 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 ASAH1Q13510 395 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 NFE4Q86UQ8 179 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 OR5C1Q8NGR4 320 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 THAP6Q8TBB0 222 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRN-215ENST00000484986 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.15■□□□□ 0.02
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