RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 C9JCJ5 164 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 M0R3E3 92 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 MED6O75586 246 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 IGLV2-11P01706 119 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 OR4E1P0C645 316 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC25A6P12236 298 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 CRISP2P16562 243 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 TNFSF8P32971 234 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 LAGE3Q14657 143 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 OPCMLQ14982 345 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 TDRG1Q3Y452 100 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 S100A7AQ86SG5 101 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 Q8N3U1 123 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 BAALCQ8WXS3 180 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RNF24Q9Y225 148 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RGS13O14921 159 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 AKAIN1P0CW23 69 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 VBP1P61758 197 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SRPXP78539 464 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RASL10AQ92737 203 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 PRRT1Q99946 306 aa9.42□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.41□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 GPX1P07203 203 aa9.41□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 PPT1P50897 306 aa9.41□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00477Q96M19 166 aa9.41□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RNF222A6NCQ9 220 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 ANXA3P12429 323 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 ODF1Q14990 250 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.4□□□□□ -0.9
RALGPS1-211ENST00000471643 LPAP08519 4548 aa9.4□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 NMBP08949 121 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MZT2AQ6P582 158 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 Q6ZRU5 148 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MUC2Q02817 5179 aa9.38□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 GAS8-AS1O95177 125 aa9.38□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 GUK1Q16774 197 aa9.38□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 AGPAT2O15120 278 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 COX7A2P2O60397 106 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF253O75346 499 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 NDUFB4O95168 129 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ID3Q02535 119 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 LELP1Q5T871 98 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 FNDC10F2Z333 226 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 GOSR2O14653 212 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MUC21Q5SSG8 566 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF546Q86UE3 836 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 Q8N976 141 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 PAXXQ9BUH6 204 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 PSENENQ9NZ42 101 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.36□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 MGST2Q99735 147 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 SPXQ9BT56 116 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 SRRQ9GZT4 340 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF492Q9P255 531 aa9.35□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 HOXB5P09067 269 aa9.34□□□□□ -0.91
RALGPS1-211ENST00000471643 ARL16Q0P5N6 197 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms