RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 TENM4Q6N022 2769 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LINC01546A6NGU7 62 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 OR2T8A6NH00 312 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 IGLC6P0CF74 106 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SAA4P35542 130 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 RHOGP84095 191 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PAX8Q06710 450 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C15orf32Q32M92 178 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LINC01545Q5VT33 79 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 USMG5Q96IX5 58 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PRELID3AQ96N28 172 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF747Q9BV97 191 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 U3KQE9 123 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 M0R3E3 92 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CLEC3BP05452 202 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 IGLL1P15814 213 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DSCR9P59020 149 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CACNG7P62955 275 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 NDPQ00604 133 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF124Q15973 351 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DEFB125Q8N687 156 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SMPXQ9UHP9 88 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF580Q9UK33 172 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 RNF114Q9Y508 228 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PRSS47A8MTI9 375 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SIVA1O15304 175 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0E1O15342 81 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TCF21O43680 179 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LY6HO94772 140 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 IGF1P05019 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 GATA3P23771 443 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CD24P25063 80 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CKS2P33552 79 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF138P52744 262 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF738Q8NE65 137 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PIFOQ8TCI5 191 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 AJUBAQ96IF1 538 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LINC00477Q96M19 166 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C8orf49Q96NF6 230 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JLM5 398 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 LINC01549A6NIU2 74 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 K7EMI3 77 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA4O00483 81 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 OVOL1O14753 267 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1-69P01742 117 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 HBDP02042 147 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ORM1P02763 201 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 GPR183P32249 361 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TWIST1Q15672 202 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ECSCRQ19T08 205 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 PTPN13Q12923 2485 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 D6R8Y8 96 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R17O96001 155 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHG4P01861 327 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 MED14OSP0DP75 135 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ATP5J2P56134 94 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP10-9P60411 292 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 BATFQ16520 125 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TPPP3Q9BW30 176 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 COL12A1Q99715 3063 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms