RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC2BQ92478 149 aa1.93□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 C5orf58C9J3I9 102 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 LZICQ8WZA0 190 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPB8Q9UJY1 196 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CECR2Q9BXF3 1484 aa1.91□□□□□ -2.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM244Q5VVB8 128 aa1.9□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa1.89□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 NINQ8N4C6 2090 aa1.89□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A4P12235 298 aa1.89□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa1.89□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 CST11Q9H112 138 aa1.89□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 KDM5CP41229 1560 aa1.89□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR97A6NE52 1622 aa1.88□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB10A6NFE3 127 aa1.88□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 MPV17LQ2QL34 196 aa1.88□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM74A1Q5RGS3 127 aa1.88□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa1.87□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 COX7CP15954 63 aa1.87□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 SPRNQ5BIV9 151 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 OR10AG1Q8NH19 301 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPM7Q96QT4 1865 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 CGREF1Q99674 301 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPRDP23468 1912 aa1.87□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 F8W1H4 67 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL25O15444 150 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL14EPLP0DKL9 152 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa1.86□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 TCEAL4Q96EI5 215 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 CALML5Q9NZT1 146 aa1.86□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 ERCC6Q03468 1493 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 MPC1LP0DKB6 136 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-205ENST00000462042 BANF2Q9H503 90 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 MYH13Q9UKX3 1938 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCA2P51531 1590 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
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