RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 Q9H8V8 135 aa14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 HSPG2P98160 4391 aa14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NMBP08949 121 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CRISP2P16562 243 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 PYYP10082 97 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ASAH1Q13510 395 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZTI0 123 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 S100ZQ8WXG8 99 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 Q9H3A6 140 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MUC4Q99102 2169 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPQ1 181 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ERCC8Q13216 396 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YY99 117 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NMES1Q9C002 83 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf90A8MZG2 172 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 E5RGE8 158 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 CDK2AP2O75956 126 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 NHLH2Q02577 135 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 CD300CQ08708 224 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 BTN1A1Q13410 526 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ESRGQ1W209 222 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 BLNKQ8WV28 456 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TCL1AP56279 114 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 THAP6Q8TBB0 222 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK4O60575 86 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ICAM4Q14773 271 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ENKURQ8TC29 256 aa14.5□□□□□ -0.09
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LIMS1-208ENST00000428064 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 OR51M1Q9H341 326 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 GPX1P07203 203 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF492Q9P255 531 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 FUT9Q9Y231 359 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 A0A096LPF7 62 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 PRAF2O60831 178 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 A6NHS1 94 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 UPK1BO75841 260 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 PRR9Q5T870 116 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD5Q96DB9 178 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 VGLL1Q99990 258 aa14.47□□□□□ -0.09
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LIMS1-208ENST00000428064 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.47□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.46□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 H0YIZ8 118 aa14.46□□□□□ -0.09
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LIMS1-208ENST00000428064 PAXXQ9BUH6 204 aa14.46□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.45□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.45□□□□□ -0.1
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LIMS1-208ENST00000428064 RGS13O14921 159 aa14.45□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF138P52744 262 aa14.45□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.45□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.44□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa14.44□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR10J4P0C629 311 aa14.43□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLAQ13239 276 aa14.43□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.43□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5SQ99766 215 aa14.43□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.43□□□□□ -0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.43□□□□□ -0.1
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